Si ya no necesita utilizar cierto paquete, puede eliminarlo de su sistema utilizando APT. Para realizar esta tarea sólo escriba: apt-get remove paquete. por ejemplo:

     # apt-get remove gnome-panel
     Reading Package Lists... Done
     Building Dependency Tree... Done
     The following packages will be REMOVED:
       gnome-applets gnome-panel gnome-panel-data gnome-session
     0 packages upgraded, 0 newly installed, 4 to remove and 1 not upgraded.
     Need to get 0B of archives. After unpacking 14.6MB will be freed.
     Do you want to continue? [Y/n]

Como se puede apreciar en el ejemplo anterior, APT se hace cargo de eliminar los paquetes dependientes del paquete eliminado. No hay manera de eliminar un paquete utilizando APT sin eliminar los paquetes que éste necesitaba.

Ejecutando apt-get como en el ejemplo causará que los paquetes sean eliminados, pero sus archivos de configuración, si existían, permanecerán intactos en el sistema. Para una eliminación completa del paquete, ejecute:

     # apt-get --purge remove gnome-panel
     Reading Package Lists... Done
     Building Dependency Tree... Done
     The following packages will be REMOVED:
       gnome-applets* gnome-panel* gnome-panel-data* gnome-session*
     0 packages upgraded, 0 newly installed, 4 to remove and 1 not upgraded.
     Need to get 0B of archives. After unpacking 14.6MB will be freed.
     Do you want to continue? [Y/n]

Observe el "*" después de los nombres. Esto indica que los archivos de configuración de cada paquete serán eliminados también.

Al igual que en el caso de la instalación, puede utilizar un símbolo con la opción de "remove" para invertir el significado de un paquete en especial. En el caso de la eliminación, si agrega un "+" después del nombre del paquete, el paquete será instalado en vez de eliminarlo.

     # apt-get --purge remove gnome-panel nautilus+
     Reading Package Lists... Done
     Building Dependency Tree... Done
     The following extra packages will be installed:
       bonobo libmedusa0 libnautilus0 nautilus
     The following packages will be REMOVED:
       gnome-applets* gnome-panel* gnome-panel-data* gnome-session*
     The following NEW packages will be installed:
       bonobo libmedusa0 libnautilus0 nautilus
     0 packages upgraded, 4 newly installed, 4 to remove and 1 not upgraded.
     Need to get 8329kB of archives. After unpacking 2594kB will be used.
     Do you want to continue? [Y/n]

Observe que apt-get enlista los paquetes que serán instalados aparte de los seleccionados (esto es, aquellos que su instalación es necesaria para el funcionamiento de aquellos que son seleccionados), aquellos que serán eliminados, y aquellos que serán instalados (incluyendo los paquetes adicionales otra vez).